Distribuição de marcadores microbianos de virulência no Atlântico Sul. Dados metagenômicos

Authors

  • Schweitzer CM, Barra RHD, Simon ME, Silva KMR, Gaetti-Jardim Júnior E

Abstract

A revolução industrial e o aumento da população global passaram a exigir recursos cada vez mais escassos e acabaram por incluir todas as províncias geológicas em um sistema integrado no qual até os oceanos mais distantes recebem o impacto do modelo produtivo e de exploração. O presente estudo teve como objetivo avaliar a presença de grupos microbianos nitidamente associados e infecções humanas e animais em águas situadas além da plataforma continental sul-americana a partir de dados livres de sequenciamento gênico. Para tanto, os dados referentes às sequências gênicas microbianas obtidas pelo sequenciamento shotgun pelo sistema Illumina® de amostras de água de superfície e de diversas profundidades, submetidas a filtração em membranas éster de celulose, com porosidade de 0,2 μm, colhidas através sistema global pelo estudo da biodiversidade marinha "Tara Oceans", nas estações 76 e 78. Os dados disponíveis junto ao portal EMBL-EBI foram analisados e agrupados a partir de banco contendo aproximadamente 4. 107 OTU (unidades taxonômicas operacionais) e mais de 1,1. 108 sequências gênicas. Os dados foram comparados com diferentes bases de dados gênicos (SILVA Database e NCBI Database) e abundância das OTUs de interesse foi comparada por meio do programa R Statistical. As mesmas sequências foram submetidas a verificação do seu potencial funcional. Os resultados permitiram a detecção de sequências gênicas características de patógenos humanos de diferentes linhagens filogenéticas, cuja identificação em nível de espécie e de gênero não puderam ser, no geral obtidas. A avaliação e predição funcional das sequencias indica importante arsenal de fatores de virulência associado à desorganização de polímeros orgânicos. Entretanto, não se pode afirmar que a origem dessas sequencias denote contaminação externa.

Descritores: Poluição da Água; Metagenômica; Padrões Moleculares Associados a Patógenos.

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Published

2019-02-06

How to Cite

Simon ME, Silva KMR, Gaetti-Jardim Júnior E, S. C. B. R. (2019). Distribuição de marcadores microbianos de virulência no Atlântico Sul. Dados metagenômicos. ARCHIVES OF HEALTH INVESTIGATION, 7. Retrieved from https://archhealthinvestigation.com.br/ArcHI/article/view/4276

Issue

Section

Patologia e Propedêutica Clínica